alopecia/data/exvivo_validation.json

151 lines
3.4 KiB
JSON

{
"_description": "실제 ex vivo 인체 모낭(GSE267664, DHT vs control)으로 트윈 AGA/DHT→Wnt억제 축 검증. n=3 소규모→방향 협응(부호검정)이 신호.",
"dataset": {
"gse": "GSE267664",
"title": "Effect of DHT modeling on AGA frontal hair follicles",
"design": "ex vivo organ-modeled human hair follicles, DHT(n=3) vs control(n=3), RNA-seq",
"vs_prior": "GSE178374는 DP세포; 본 데이터는 전체 모낭 → 더 강한 ex vivo 근거"
},
"markers": [
{
"gene": "DKK1",
"role": "Wnt 길항",
"pred": "up",
"log2fc": 1.133,
"p": 0.0793,
"obs": "up",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "DACT1",
"role": "Wnt 길항",
"pred": "up",
"log2fc": 0.781,
"p": 0.3268,
"obs": "up",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "SFRP1",
"role": "Wnt 길항",
"pred": "up",
"log2fc": 0.101,
"p": 0.941,
"obs": "up",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "SFRP2",
"role": "Wnt 길항",
"pred": "up",
"log2fc": 0.273,
"p": 0.7892,
"obs": "up",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "LEF1",
"role": "Wnt 표적",
"pred": "down",
"log2fc": -0.241,
"p": 0.6833,
"obs": "down",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "AXIN2",
"role": "Wnt 표적",
"pred": "down",
"log2fc": -0.186,
"p": 0.77,
"obs": "down",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "TCF7",
"role": "Wnt 표적",
"pred": "down",
"log2fc": -0.003,
"p": 0.9933,
"obs": "down",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "KRT35",
"role": "모발케라틴",
"pred": "down",
"log2fc": -0.194,
"p": 0.8898,
"obs": "down",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "KRT85",
"role": "모발케라틴",
"pred": "down",
"log2fc": -0.171,
"p": 0.8699,
"obs": "down",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "KRT81",
"role": "모발케라틴",
"pred": "down",
"log2fc": 0.001,
"p": 0.9995,
"obs": "up",
"match": false,
"in_test": true
},
{
"gene": "KRT31",
"role": "모발케라틴",
"pred": "down",
"log2fc": -0.185,
"p": 0.8431,
"obs": "down",
"match": true,
"in_test": true
},
{
"gene": "FKBP5",
"role": "AR표적(양성대조)",
"pred": "up",
"log2fc": 0.112,
"p": 0.9202,
"obs": "up",
"match": true,
"in_test": false
},
{
"gene": "SRD5A2",
"role": "안드로겐(양성대조)",
"pred": "up",
"log2fc": 0.214,
"p": 0.8319,
"obs": "up",
"match": true,
"in_test": false
}
],
"concordance": {
"n_test": 11,
"n_match": 10,
"sign_test_p": 0.0059
},
"key_DKK1": {
"log2fc": 1.133,
"p": 0.0793
},
"honest": "n=3 소규모로 개별 유전자 q≈1; 신호는 Wnt축 방향 협응. BMP·비정준 Wnt 제외."
}